Освящение восстановленного Свято-Троицкого монастыря было совершено Епископом Владимирским и Суздальским Евлогием (Смирновым) 15 мая 1991 года - в день, когда Православная Церковь молитвенно вспоминает перенесение мощей святых братьев-страстотер­пцев Бориса и Глеба, которые всегда были здесь особо почитаемы. Свято-Троицкий монастырь стоит на месте древнего Борисоглебского кафедраль­ного собора.Издавна святой Глеб, как первый Муромский князь, был небесным покровителем Муромо-Рязанской земли. И в Муроме и в Рязани древние кафедральные соборы были посвящены святым братьям-страстотерпцам. Троицкий монстырь расположен в самом центре древнего Мурома, в Старом Вышнем Городище. Это историческая территория, относящаяся к периоду раннего средневековья, когда Муром был столицей княжества.Вышнее городище упоминается в "Повести о водворении христианства в Муроме". Старое городище было окопано земляным валом, останки которого сохранились до наших дней под стенами монастыря.В течении XIII века город неоднократно подвергался татарским разорениям. В 1351-55 году город был отстроен муромским князем Юрием Ярославичем. При князе Константине Муромском и его сыновьях Михаиле и Фёдоре возводится Борисоглебский храм.В 1624 году его заменяет деревянная церковь Святой Троицы. В 1642-1643 годах, на деньги купца Цветнова Т. Б., возводится новый Троицкий храм из камня. Стены щедро украсили декоративными узорами, изразцами и полуколоннами.Купола венчают кованые золочёные кресты. После строительства церкви купец обращается к епископу Рязанскому и Муромскому об основании на месте Троицкого прихода девичьего монастыря. Для новой обители он пожертвовал свой дом и выкупил соседние земли для монастырского хозяйства. Через пять лет над вратами обители возводится миниатюрная шатровая церковь во имя Казанской иконы Божией Матери.В 1652 году возводится многоярусная колокольня. В XVII веке монастырь расширяет свои владения. При императрице Екатерине II численность монахинь значительно увеличивается. На рубеже XVIII-XIX веков монастырь сильно пострадал от двух пожаров. Благодаря купцу Зворыкину Г. Ф. и вдове Нейманове А. Д. постройки монастыря восстановлены и улучшены. В 1898 году открывается одноклассная женская школа с уроками рукоделия в построенном двухэтажном корпусе. После белогвардейского восстания 1918 года в городе было введено военное положение. Был закрыт Спасо-Преображенский монастырь и епископ Муромский Митрофан был вынужден найти прибежище в Троицком монастыре. В 1921 году монастырь был закрыт.

Свято-Троицкий женский монастырь - один из первых возвращённых Русской Православной Церкви монастырей во Владимирско-Суздальской епархии. Открытие монастыря произошло в день памяти святых князей - страстотерпцев Бориса и Глеба 15 мая 1991 года.Постройки монастыря были в аварийном состоянии. В восстановлении монастыря принимали участие монахини и добровольцы из числа местных жителей. При монастыре возрождается древнейший вид рукоделия - лицевое шитьё. Открыта монастырская воскресная школа. С 2000 года открылся приют для девочек, которые в стенах обители получают образование с музыкальным уклоном, обучаться переплётному делу, рукоделию и вышивке золотом.7 апреля 2001 года официально открылся пансионат "Надежда" для несовершеннолетних детей, а в 2002 году открыто отделение Киржачского профессионального училища №55.Сегодня в Свято-Троицком монастыре положено начало возрождению древней традиции православного воспитания русской женщины. Ведь недаром, древний Муром называют родиной идеальных женских характеров.